Анализ данных с помощью pandas. Часть 8: работа с данными из базы данных SQL

До этого момента, мы получали данные только из csv файлов. Это довольно распространённый способ сохранения данных, но далеко не единственный! Pandas может работать с данными из HTML, JSON, SQL, Excel (!!!), HDF5, Stata, и некоторых других вещей. В этой части мы поговорим о работе с данными из баз данных SQL.

import pandas as pd
import sqlite3

Чтение из SQL баз данных

Загрузить данные из SQL базы можно с помощью функции pd.read_sql. read_sql автоматически преобразует столбцы SQL в столбцы DataFrame.

read_sql принимает 2 аргумента: запрос SELECT, и connection. Это здорово, так как это означает, что можно читать из любого вида базы данных - неважно, MySQL, SQLite, PostgreSQL, или другая.

В этом примере мы читаем из базы SQLite, но другие читаются точно также. Файл, с которым мы будем работать.

con = sqlite3.connect("data/weather_2012.sqlite")
df = pd.read_sql("SELECT * from weather_2012 LIMIT 3", con)
df

read_sql не устанавливает первичный ключ (id) в качестве индекса. Можно это сделать вручную, добавив аргумент index_col к read_sql.

Если вы много использовали read_csv, вы могли заметить, что у него также есть аргумент index_col. И ведёт он себя точно так же.

df = pd.read_sql("SELECT * from weather_2012 LIMIT 3", con, index_col='id')
df

Если вы хотите, чтобы dataframe был индексирован несколькими столбцами, в index_col можно указать их список:

df = pd.read_sql("SELECT * from weather_2012 LIMIT 3", con, 
                 index_col=['id', 'date_time'])
df

Запись в базу

Запись производится с помощью метода to_sql (по аналогии с CSV):

weather_df = pd.read_csv('data/weather_2012.csv')
con = sqlite3.connect("data/test_db.sqlite")
con.execute("DROP TABLE IF EXISTS weather_2012")
weather_df.to_sql("weather_2012", con)

/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pandas/core/generic.py:1345: UserWarning: The spaces in these column names will not be changed. In pandas versions < 0.14, spaces were converted to underscores.
  chunksize=chunksize, dtype=dtype)

Теперь мы можем загрузить записанные данные:

con = sqlite3.connect("data/test_db.sqlite")
df = pd.read_sql("SELECT * from weather_2012 LIMIT 3", con)
df

Главное преимущество хранения данных в базе в том, что можно напрямую делать SQL запросы. Это особенно хорошо, если SQL для вас более родной язык. Например, можно отсортировать по колонке 'Weather' с помощью лишь SQL:

con = sqlite3.connect("data/test_db.sqlite")
df = pd.read_sql("SELECT * from weather_2012 ORDER BY Weather LIMIT 3", con)
df

Другие базы данных

Для подключения к MySQL:

Чтобы это работало, у вас на машине должна быть установлена соответствующая база данных

import MySQLdb
con = MySQLdb.connect(host="localhost", db="test")

PostgreSQL:

import psycopg2
con = psycopg2.connect(host="localhost")