Python developer - bioinformatics

Миссия BostonGene - способствовать переходу здравоохранения к персонализированной медицине с использованием нашего молекулярного и иммунного профилирования на основе искусственного интеллекта для повышения уровня медицинской помощи, ускорения исследований и улучшения экономики медицинской системы.

Мы открываем вакансию для разработки программной платформы, которая поможет улучшить точность назначения противораковой терапии.

Проект по анализу иммунного статуса был начат в 2020 году, в его ходе команда иммунологов и биоинформатиков занималась поиском того, как состояние иммунитета человека может помочь в диагностике и лечении заболеваний. И теперь, спустя год, мы ищем разработчика, который сможет взять на себя ответственность за разработку и интеграцию нового пайплайна для обработки данных, получаемых из нашей лаборатории в Бостоне.

Описание проекта:

На данный момент у нас есть набор google sheet-ов с данными, разрозненные файлы с результатами экспериментов и множество обрабатывающих скриптов. Все эти разработки необходимо будет объединить в работающую систему и интегрировать с нашим основным продуктом - системой, генерирующей персональные рекомендации для подбора противораковой терапии.

Задачи:

• Писать пайплайны обработки данных;

• Придумывать решения оптимальные каждой встреченной ситуации;

• Искать существующие процессы, подсвечивать и автоматизировать их;

• Собирать данные и предоставлять для использования своей команде. Иногда можно даже писать интерфейсы;

• Помогать биоинформатикам по части разработки;

• Написание API для доступа к данным для других сервисов;

• Общаться с другими командами, искать общие места и ставить задачи;

• Чуть позже после начала: придумывать, какие сервисы оптимизируют работу других людей или подразделений.

Основные требования:

• 2+ года опыт коммерческой разработки на Python;

• Разработка под Linux;

• Знание и опыт использования облачных сервисов и технологий виртуализации (Kubernetes, Docker, опыт взаимодействия с облачными платформами: GCS, AWS, Azure) будет плюсом;

• Опыт с Airflow и pandas;

• Опыт работы с PostgreSQL;

• Жгучее желание узнавать новое. Это понадобится для совместной работы со специалистами-биоинформатиками (мы поможем);

• Готовность работать в проекте с высоким уровнем неопределенности.

Будет плюсом:

• Опыт работы в науке / лаборатории.

• Базовые знания биологии/биоинформатики.

• Знание английского B2+ (может понадобиться общаться с коллегами из США).

• Знакомство с Kubernetes, Helm.

Условия:

• Работа в перспективной сфере - персонализированная медицина в команде выпускников лучших ВУЗов (МГУ, МФТИ, ВШЭ, СколТех, Первый мед и т.д.);

• Жизнь в команде биоинформатиков, биологов, медиков и разработчиков;

• Полный рабочий день;

• Офис в 5 минутах от ст. м. Павелецкая;

• Удаленная/гибридная работа, рассматриваем кандидатов, которые постоянно проживают на территории РФ;

• ДМС, корпоративные программы, обучение;

• Вознаграждение определяется по результатам собеседования.

Откликнуться Другие вакансии Добавить/выделить свою вакансию (работодателям)